Seit 2013 übernimmt das Johann-Adam-Möhler Institut die Verantwortung für das Stipendienprogramm der Deutschen Bischofskonferenz für orthodoxe Theologinnen und Theologen.
In Regensburg war das Stipendienprogramm 51 Jahre beheimatet bis es nun seit 10 Jahren in Paderborn weitergeführt wird.
Es haben weit über tausend Vertreter und Vertreterinnen der orthodoxen Kirchen mit einem Stipendium der Deutschen Bischofskonferenz studiert und in Deutschland die Möglichkeiten genutzt, die westlichen Kirchen näher kennen zu lernen. Zugleich haben sie die Gelegenheit wahrgenommen, in Deutschland mit Studierenden der anderen orthodoxen Kirchen in einen intensiveren Austausch zu treten. Der Schwerpunkt ihres Aufenthaltes liegt in der Vertiefung ihrer Kenntnisse der deutschen Sprache. Dazu besuchen sie einen universitären Sprachkurs. So ist es ihnen möglich, sich für einen intensiveren zwischenkirchlichen Dialog einzusetzen.